木葉52年開始,也就是4天後.三代火影剛重新上台幾天，召開木葉大會。大會的主要內容就是關於對宇智波一族控製九尾的處理，會議通過了關於將宇智波調動到角落的決定，之後又對木葉相關建設和三戰爭尾聲的部署，木葉招商引資計劃等。
宇智波眾人對於指控非常憤怒，覺得無端受到到了指控，尤其是開啟過寫輪眼的宇智波人，9尾襲擊時明明很想去幫忙卻收到命令保護村民，這是對宇智波的褻瀆。而暗部和很多目擊忍者在九尾襲擊時記錄下九尾的眼睛出現寫輪眼圖案，明顯是被寫輪眼所控製，但宇智波富嶽出示了木葉所記錄的所有宇智波都有在九尾之夜的明確出行記錄，但當時太混亂證據並不全麵，最終宇智波富嶽接受了從木葉中心搬遷住址的決定。搬遷之後宇智波對村長的不滿漸漸加深，這群愚昧的傢夥，作為木葉的第一家族，高貴的宇智波還不想跟你們住一起呢。之後警衛隊對於犯法的村民執法開始漸漸粗暴以表達對於村長的不滿。
火之國火之寺，空每天都承受著暴亂查克拉的折磨，因為另一時空9尾查克拉也聚集最近幾天剛好受一點，他的體內被和馬移植了九尾殘存的一部分查克拉，成為九尾仿人柱力，比原本強大了一點。
木葉與岩隱目前還在零星戰鬥中，隨著間諜獲得四代火影的戰死的訊息後終於鬆了口氣，遇到黃色閃光就逃跑的恥辱指令終於不用再對村子的忍者交代，對於四代火影的仇恨在岩隱忍者裡有相當一部分人。與土之國的戰爭不是短時間能結束的，袁飛日斬經過思考決定隱瞞鳴人為四代火影孩子的決定，由於袁飛日斬隻交代了四代火影一家戰死，抱走嬰兒時在場除了暗部並未有其他，目前在暗部的卡卡西並不知道九尾人柱力是老師的孩子，而自來也隻是匆匆回來得到弟子一家全部戰死的訊息，同時妙木山有緊急召喚，比較馬虎的他隻聽了弟子全家死亡就傷心悲痛得離開，並不知道漩渦鳴人是四代的孩子，三代作為火影隨著戰事越來越忙最終把鳴人最終像普通孤兒一樣寄養在孤兒院。（火影初期設定鳴人並不是四代孩子，卡卡西開始對他還是比較普通的，卡卡西當時設定跟四代還真冇啥關係，自來也肯作為鳴人老師有可能三代告訴他些事，早些年冇管過鳴人也隻有這樣解釋合理點）
同年，三代火影猿飛日斬親自帶隊偵破反人類試驗隱藏據點，大蛇丸人體實驗敗露，叛逃木葉，建立新據點，逐步發展成割據一方的勢力。
木葉53年，岩隱與木葉正在戰爭，兜成為間諜，最終如原著一樣殺死院長，決定跟著大蛇丸。佩恩最終擊殺了半藏，之後大蛇丸遇到了佩恩打算奪取輪迴眼，加入曉組織，長門對大蛇丸這種惡棍冇有什麼好感。大蛇丸剛想動手就被輪迴眼的力量震驚，曉目前確實缺人缺錢也就冇殺大蛇丸，曉組織目前還是在招募中暫時也冇什麼任務，大蛇丸加入也隻是放養中。
木葉54年，四代雷影繼任，雷之國代表團派出成員打算跟木葉簽署停戰協定，目前雷之國在對木葉的戰鬥中處於優勢，木葉目前隻和砂忍擁有停戰協定，水之國目前處於封閉狀態，岩隱與木葉尚在戰鬥。雖然打算簽署停戰協定，鷹派成員不滿在同時下達了綁走日向女孩或者宇智波女孩到雷之國的命令，希望能在雷之國擁有這兩種血繼界限，選定代表團準備奔赴木葉。
鳴人已經四歲了，因為之前穿越者思維碎片融入靈魂的原有思想上比較成熟，本岸也終於與鳴人進行第一次對話。
鳴人被拉入心靈空間，因為本岸存在鳴人的內心一處特殊空間與封印空間並不相同並不需要查克拉。
啊，這是哪裡啊，我不是在家裡呆著嗎？鳴人有些害怕，不過還是靜靜的觀察著一切。
本岸：孩子，初次見麵，我是忍界的創造者，曾經的忍界意誌，我擁有多重化身，比如祖之國天子，忍界四大聖地創始人，忍界曆史學家岸本齊史。。。等等。
鳴人：好厲害的樣子，你找我有什麼事嗎。
本岸：目前的你已經擁有了相關智商，我目前屬於幽魂狀態，類似你腦海曾想像過的係統。
鳴人：真的嗎，我就像主角一樣也擁有一個心想事成的係統啊，需要完成各種任務，有新手禮包發吧？
本岸：抱歉，冇有，隻是像係統一樣能溝通，也冇有什麼任務給你，我就是終於能有個說話的人了。
鳴人：啊，什麼呀，這係統弱爆了吧，不過我也挺孤獨的，為什麼我冇有父母你知道嗎。
本岸：如果冇有意外你的父母應該是戰死了，按設定你的父母應該是四代火影。
鳴人：什麼叫應該啊？難道不是嗎。
本岸：本來我應該什麼都知道的，但我已經失去了預知的力量，新的世界規則下怎麼演變我還真不知道。
鳴人：啊，冇懂，什麼意思。
本岸：我把一切都放給你看吧。
隨手一揮，出現大螢幕開始播放關於火影的一切，從此之後幾個月每天鳴人就在屋裡發呆很久，觀看著火影忍者，各種番外，劇場版，博人轉。